Theo đó, cơ sở tôn giáo có nhu cầu chính đáng về nhà đất phục vụ cho hoạt động tôn giáo thì UBND tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có trách nhiệm xem xét căn cứ vào chính sách tôn giáo của nhà nước, quy hoạch kế hoạch sử dụng đất và quỹ đất của địa phương theo đúng trình tự, thủ tục quy định của pháp luật. Nhà đất liên quan đến tôn giáo mà Nhà nước đã quản lý, bố trí sử dụng thì cơ quan, tổ chức được giao quản lý, phải sử dụng đúng mục đích, có hiệu quả. Trường hợp sử dụng không đúng mục đích, thì UBND tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thu hồi để bố trí sử dụng phục vụ lợi ích quốc gia, lợi ích công cộng.

Công văn số 3371 của Bộ nội vụ về việc thực hiện Chỉ thị 1940 cũng nhấn mạnh, các sở, ban ngành có liên quan và UBND cấp huyện có nhiệm vụ rà soát, thống kê tình hình quản lý, sử dụng nhà, đất liên quan đến tôn giáo tại địa phương, tổ chức thanh tra, kiểm tra định kỳ về tình hình sử dụng nhà đất của các cơ sở tôn giáo để báo cáo về UBND tỉnh, thành phố.