Mục tiêu chương trình sức khỏe học đường giai đoạn 2021-2025 nhằm duy trì, đẩy mạnh hoạt động giáo dục, chăm sóc, bảo vệ và quản lý sức khỏe trẻ em, học sinh trong các cơ sở giáo dục mầm non và phổ thông; bảo đảm sự phát triển toàn diện về thể chất, tinh thần cho học sinh.