Với những thành tích đặc biệt xuất sắc, năm 2023, Tổng cục II vinh dự được Đảng, Nhà nước tặng thưởng Huân chương Chiến công hạng Nhất; một số tập thể, cá nhân thuộc Tổng cục được tặng thưởng Huân chương Chiến công và Bằng khen của Thủ tướng Chính phủ