Hệ sinh thái khởi nghiệp là tổng hợp các mối quan hệ, tương tác lẫn nhau giữa mô hình khởi nghiệp với nhiều yếu tố khác nhau như: quỹ hỗ trợ khởi nghiệp, các vườn ươm, các chương trình và chính sách hỗ trợ khởi nghiệp…, là các điều kiện để phát triển khởi nghiệp. Hưởng ứng chương trình quốc gia khởi nghiệp, những năm gần đây, các tỉnh trong khu vực đồng bằng sông Cửu Long đã triển khai nhiều chương trình, chính sách, góp phần thúc đẩy phát triển phong trào khởi nghiệp, hình thành hệ sinh thái khởi nghiệp tại địa phương.